Le génome du bananier séquencé

Angélique d'Hont

La nouvelle a fait la une des journaux scientifiques : le génome du bananier est séquencé. Ce travail réalisé par le Cirad offre des perspectives tant sur le côté sécurité alimentaire qu’économique pour plus de 400 millions de personnes.

 

© J.-F. Coffin

 

© J.-F. Coffin

 

Le séquençage de la banane va permettre de mieux lutter contre les menaces parasitaires

Le Cirad et le CEA-Genoscope, avec le soutien financier de l’ANR, viennent d’achever le séquençage du génome du bananier à partir de l’espèce Musa acuminata (n=11= 520 Mb), qui entre dans la composition de toutes les variétés comestibles, bananes desserts ou à cuire. Les résultats ont été publiés en ligne dans la prestigieuse revue scientifique Nature.
 

 

Une aide essentielle pour l’amélioration des variétés

Capital pour la sécurité à la fois alimentaire et économique de plus de 400 millions de personnes des pays du Sud, le bananier est soumis à des menaces parasitaires constantes. De nombreuses variétés sont cultivées mais la moitié de la production mondiale est issue d’un groupe de variants somaclonaux (issus d’une seule graine). Ceci favorise l’émergence de maladies et conduit à l’emploi important de pesticides dans les grandes plantations. La création de nouvelles variétés plus résistantes est donc une nécessité, même si elle est compliquée par la très faible fertilité des bananiers cultivés. La séquence désormais disponible (http://banana-genome.cirad.fr) permet d’accéder à l’ensemble des gènes de cette plante - plus de 36 000 – et à leur position le long de ses onze chromosomes. Cette connaissance facilitera considérablement l’identification des gènes responsables de caractères tels que la résistance aux maladies et la qualité des fruits. Elle fournira au final une aide essentielle à l’amélioration des variétés de bananiers à partir des nombreuses ressources génétiques disponibles dans le monde.

Plus de 36 000 gènes sur 11 chromosomes - © CIRADPlus de 36 000 gènes sur 11 chromosomes ©CIRAD

Plus de 36 000 gènes sur 11 chromosomes - © CIRAD


Un nouveau regard sur l’évolution des génomes

Le bananier est la première plante de sa classe botanique (les monocotylédones), à côté des céréales, pour laquelle un séquençage abouti (ancré sur les chromosomes) a été obtenu. Il constitue à ce titre une référence de grande valeur pour étudier l’évolution des génomes. Les chercheurs ont ainsi pu établir que le bananier a connu trois épisodes de duplication complète du génome, indépendants de celles constatées dans la lignée des graminées. Si la plupart des gènes issus de ces évènements de duplication sont ensuite perdus, certains persistent et permettent l’émergence de nouvelles fonctions biologiques.
 

Références

'The banana (Musa acuminata) genome and the evolution of monocotyledonous plants' 10.1038/nature11241. Advance Online Publication (AOP) on http://www.nature.com/nature.